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浏览/检索结果: 共11条，第1-10条 帮助 条数/页： 5101520253035404550556065707580859095100 排序方式： 请选择题名升序题名降序提交时间升序提交时间降序作者升序作者降序发表日期升序发表日期降序 A new paradigm for applying deep learning to protein-ligand interaction prediction 期刊论文  OAI收割 BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2024, 卷号: 25, 期号: 3, 页码: 12 作者:  Wang, Zechen;  Wang, Sheng;  Li, Yangyang;  Guo, Jingjing;  Wei, Yanjie   |  收藏  |  浏览/下载：3/0  |  提交时间：2024/12/06 protein-ligand interaction  scoring function  deep learning  graph neural network   Improving the Virtual Screening Ability of Target-Specific Scoring Functions Using Deep Learning Methods 期刊论文  OAI收割 FRONTIERS IN PHARMACOLOGY, 2019, 卷号: 10, 页码: 11 作者:  Wang, Dingyan;  Cui, Chen;  Ding, Xiaoyu;  Xiong, Zhaoping;  Zheng, Mingyue   |  收藏  |  浏览/下载：18/0  |  提交时间：2020/07/01 virtual screening  target-specific scoring function  deep learning  drug discovery  DUD-E   Ensemble docking-based virtual screening toward identifying inhibitors against Wee1 kinase 期刊论文  OAI收割 FUTURE MEDICINAL CHEMISTRY, 2019, 卷号: 11, 期号: 15, 页码: 1889-1906 作者:  Li, Yaping;  Wu, Dong-mei;  Kong, Ling-mei;  Zhang, Shuqun;  Du, Haibo   |  收藏  |  浏览/下载：28/0  |  提交时间：2020/03/26 bioassay  ensemble docking  scoring function  virtual screening  Wee1 inhibitors   Reoptimized UNRES Potential for Protein Model Quality Assessment 期刊论文  OAI收割 GENES, 2018, 卷号: 9, 期号: 12, 页码: 601 作者:  Faraggi, E;  Krupa, P;  Mozolewska, MA;  Liwo, A;  Kloczkowski, A   |  收藏  |  浏览/下载：45/0  |  提交时间：2019/07/19 RESIDUE FORCE-FIELD  KNOWLEDGE-BASED POTENTIALS  ACCESSIBLE SURFACE-AREA  STRUCTURE PREDICTION  MOLECULAR-DYNAMICS  STATISTICAL POTENTIALS  STRUCTURE SIMULATIONS  POLYPEPTIDE-CHAINS  SCORING FUNCTION  WEB SERVER   Molecular docking for drug discovery and development: a widely used approach but far from perfect 期刊论文  OAI收割 FUTURE MEDICINAL CHEMISTRY, 2016, 卷号: 8, 期号: 14 作者:  Wang, Guimin;  Zhu, Weiliang   |  收藏  |  浏览/下载：26/0  |  提交时间：2019/01/08 covalent binding  free energy  molecular docking  scoring function  solvent molecule  structural flexibility  thermodynamics and kinetics   A quantum mechanics-based halogen bonding scoring function for protein-ligand interactions 期刊论文  OAI收割 JOURNAL OF MOLECULAR MODELING, 2015, 卷号: 21, 期号: 6 作者:  Yang, Zhuo;  Liu, Yingtao;  Chen, Zhaoqiang;  Xu, Zhijian;  Shi, Jiye   |  收藏  |  浏览/下载：15/0  |  提交时间：2019/01/08 Halogen bonding  sigma-hole  Protein-ligand interaction  Quantum mechanics  Scoring function   Force fields and scoring functions for carbohydrate simulation 期刊论文  OAI收割 CARBOHYDRATE RESEARCH, 2015, 卷号: 401, 页码: 73-81 作者:  Xiong, Xiuming;  Chen, Zhaoqiang;  Cossins, Benjamin P.;  Xu, Zhijian;  Shao, Qiang   |  收藏  |  浏览/下载：31/0  |  提交时间：2019/01/08 Carbohydrate force field  Scoring function  Simulation  Drug design  Carbohydrate-protein interaction   A quantum mechanics-based halogen bonding scoring function for protein-ligand interactions 期刊论文  OAI收割 JOURNAL OF MOLECULAR MODELING, 2015, 卷号: 21, 期号: 6, 页码: 138-138 作者:  Yang, Z;  Liu, YT;  Chen, ZQ;  Xu, ZJ;  Shi, JY 收藏  |  浏览/下载：25/0  |  提交时间：2015/07/22 Halogen bonding  sigma-hole  Protein-ligand interaction  Quantum mechanics  Scoring function   A knowledge-based halogen bonding scoring function for predicting protein-ligand interactions 期刊论文  OAI收割 JOURNAL OF MOLECULAR MODELING, 2013, 卷号: 19, 期号: 11, 页码: 5015-5030 作者:  Liu, Yingtao;  Xu, Zhijian;  Yang, Zhuo;  Chen, Kaixian;  Zhu, Weiliang   |  收藏  |  浏览/下载：25/0  |  提交时间：2019/01/08 Halogen bonding  Knowledge-based scoring function  Potential of mean forces  Protein-ligand interaction  sigma-hole   Water PMF for predicting the properties of water molecules in protein binding site 期刊论文  OAI收割 JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY, 2013, 卷号: 34, 期号: 7, 页码: 583-592 作者:  Zheng, Mingyue;  Li, Yanlian;  Xiong, Bing;  Jiang, Hualiang;  Shen, Jingkang   |  收藏  |  浏览/下载：23/0  |  提交时间：2019/01/08 potential of mean forces  statistical potential  scoring function  molecular modeling  drug design  solvent prediction  water structure  explicit solvent  hydration site  three-dimensional reference interaction site model